2000年之前，欧洲最大的洲际篮球赛事是FIBA欧洲篮球锦标赛。2000年夏天，延续42年的篮球冠军联赛落下帷幕。那年夏天，皇马、巴萨、AEK、博洛尼亚等欧洲篮球豪门在卢森堡成立了一家名为“”的公司，并成立了自己的联赛——欧洲篮球联赛。首届比赛共有24支球队参赛。
对此，国际篮联成立了国际篮联，包括帕纳辛奈科斯、特拉维夫马卡比、莫斯科中央陆军等豪门球队也纷纷效仿国际篮联，共有20支球队参赛
于是2001年夏天，欧洲篮球赛场上出现了两个冠军，国际篮联这边的冠军是特拉维夫马卡比，欧洲篮球联赛这边的冠军是博洛尼亚——那一年的欧洲篮球联赛总决赛MVP就是博洛尼亚后卫吉诺比利。
2001年夏天欧洲篮球联赛 赛制，随着欧洲两大篮球联赛的落幕，国际篮联和欧洲篮球联赛决定坐下来谈判欧洲篮球联赛 赛制，由于欧洲篮球联赛拥有更好的赞助商、更强大的俱乐部和更优厚的资源，国际篮联最终选择接受欧洲篮球联赛的条件，两大联赛正式合并。
此后国际篮联彻底退出欧洲俱乐部比赛，将其交给豪门球队承办的欧洲篮球联赛欧洲篮球联赛 赛制，只负责承办篮球欧洲杯、世界杯预选赛和奥运会预选赛。欧洲篮球公司接手俱乐部比赛，豪门球队与国际篮联的博弈落空。
现行欧洲篮球联赛为18支球队制，其中11支球队拥有“永久参赛权”，这11支俱乐部也是欧洲篮球联赛公司的股东，其余7个名额则由数支持有2年期“A级参赛证”的俱乐部和数支持有1年有效期“B级参赛证”的俱乐部以及上一年度的冠军组成。
与如今的欧足联类似，国际篮联曾威胁，如果球员参加欧洲篮球联赛，将被禁止参加国际篮联赛事，但这一威胁从未实现。相反，与NBA一样，尽管从未明确规定，但欧洲篮球联赛从未向国际篮联国际比赛日让步。
