新联赛成立前，新加坡国家队一直参加马来西亚足总主办的马来西亚超级联赛，是马来西亚金杯赛的传统强队之一。1994年，新加坡队虽然夺得马来西亚联赛和金杯赛双冠王，但新加坡足总无法接受马来西亚州足总提出的1995赛季门票收入要求，并对马来西亚足总指责新加坡足总打击假球等腐败行为力度不够感到强烈不满。新加坡足总决定退出马来西亚足总主办的所有赛事，并于1996年成立了自己的新加坡职业足球联赛。
新联赛第一个赛季采用双系列赛制，即当年的比赛分为两个独立的联赛，各自冠名，然后由两个联赛的冠军决出当年的冠军。但这种双系列赛制在第二年就被取消了新加坡职业足球联赛，因为赛季太长，球迷的兴趣无法维持太久。1997赛季，新联赛改为单系列赛主客场制，12支球队进行三轮主客场比赛，第三轮主场球队以抽签方式确定。单场比赛积分计算方式为胜方得3分，负方得0分，平局双方各得1分。三轮比赛结束后，累计积分最高的球队获得联赛冠军。若球队积分相同，则以进球数和失球数的差值以及进球数来区分名次。
由于新加坡球员实力有限，为了通过联赛推动新加坡足球的提高，各俱乐部不仅大力引进欧美、非洲等外援，还积极推动其他国家球队整体加入新加坡联赛，希望通过“借鸡下蛋”的方式提高新联赛的水平。2003年，队员全部为华人的鑫奇队参加了新联赛。2006赛季，以非洲人为主力球员的非洲竞技队，
（FC）成为新联赛成员，可惜一年之后，非洲竞技队因缺少赞助商而不得不选择退出，而广元队和韩国红超队则顺利通过新足协的考察，成为新联赛的最新成员。
截至目前，今年新加坡联赛已经进行了25轮，新加坡陆军和内政联分别以62分和59分位居榜首新加坡职业足球联赛，紧随其后的是积分57分的淡滨尼，他们也将是本赛季冠军的最有力争夺者。目前为止，拥有8名申花队员的广元队以24分排名第十。
值得一提的是，在7月份申花球员租借加盟之前，广元队仅积10分新加坡职业足球联赛，位列积分榜倒数第二。
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