索默是在瑞士巴塞尔青训出身的。 2005年转会至巴塞尔俱乐部，2007年被租借至瑞士乙级联赛的瓦杜兹俱乐部，在随后的四个赛季中出场170次，夺得四次联赛冠军。 2014年瑞士足球甲级联赛，索默加盟德国球队门兴格拉德巴赫。在2021/22赛季德甲第四轮对阵拜仁慕尼黑的比赛中，他做出了19次扑救，打破了有相关统计以来德甲门将的单场扑救纪录。 2022年，索默随瑞士国家队征战2022年卡塔尔世界杯。 11月24日，世界杯小组赛首轮比赛中，他触球41次，并做出5次扑救。他被国际足联评为本场比赛最佳球员。 2023年1月，索默转会拜仁慕尼黑并随队夺得德甲冠军。同年8月7日加盟意大利球队国际米兰。 2024年4月23日，意甲第33轮，索默尔首次登场，帮助国米2-1击败AC米兰，提前5轮锁定意甲冠军。
扬·索默在2016年、2018年和2021年三度获得“足球先生”荣誉。索默在2021年欧洲杯上表现出色瑞士足球甲级联赛，帮助瑞士队杀入八强。四分之一决赛，瑞士队与法国队在常规时间和加时赛中打成3-3平，最终进入点球大战。点球大战中，索默扑出了法国球星姆巴佩的点球瑞士足球甲级联赛，帮助瑞士队淘汰了法国队，晋级八强。
